在过去十年中,从个性化医疗角度来看,人类微生物组的研究无疑是最令人兴奋和扩展最快的领域之一。技术的发展和越来越多的可用数据已经改变了微生物组科学,丰富了我们对微生物组如何受生活方式选择和生活环境影响,以及它如何反映我们的健康状况的认识。精确健康研究的重点已经从分析宿主DNA转移到研究宿主相关的因素,包括微生物群落等。因此,对具有一定人口规模的微生物群和健康关系的研究是极其重要的。近日,在Nat Commun发表的一篇题为“Gut metagenome associations with extensive digital health data in a volunteer-based Estonian microbiome cohort”的研究性论文阐明了肠道宏基因组与爱沙尼亚志愿者群体数字健康数据的关联。
爱沙尼亚生物库(EstBB)是欧洲领先的志愿者生物库,覆盖了该国近20%的成人人口(> 20万参与者≥18岁)。在这项研究中,研究人员分析了来自EstBB的2500多名参加爱沙尼亚微生物组项目(EstMB)的成年人的肠道微生物组组成,包括粪便样本收集和综合表型分析。建立该项目的是研究微生物组在健康和疾病中的作用,并评估其作为促进个性化医疗手段的潜力。
研究人员通过使用深度宏基因组测序,分析了来自深度宏基因组测序的粪便数据以及丰富的表型,包括71种疾病、136种药物、21种饮食问题、5种医疗程序和19种其他因素。研究确定了与不同微生物群特征的众多关系(n = 3262)。通过分析,确定了50种疾病、47种药物、20种饮食因素、5种内在因素、4种医疗程序和14种其他因素对肠道菌群的影响,解释了10.14%的肠道微生物组成的个体间变异和10.48%的微生物功能变异。研究人员通过电子病历来研究长期用药对粪便微生物群的影响,结果表明,长期使用抗生素对肠道微生物群落多样性有显著的影响,这可能部分解释了疾病之间共享生态失调。
总之,在这项研究中,研究人员使用电子健康数据扩展了人们对微生物群落-宿主相互作用的认识,并表明长期使用抗生素对肠道微生物群落组成有显着的影响,部分解释了疾病之间的共同关联。
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